Әлемдік стандарттарға сай сапалы білім беруді қамтамасыз ету, бәсекеге қабілетті мамандарды даярлау, сондай-ақ қазіргі заманғы кәсіби және басқа да қажетті құзыреттерге ие жоғары адамгершілікті тұлғаны қалыптастыру. Негізгі құралдар – қоғамның, мемлекеттің және жеке тұлғаның қажеттіліктеріне жауап беретін нақты ғылыми жетістіктер, оқу үдерісіне заманауи оқыту әдістерін енгізу, жаһандық өзгерістерге икемді бейімделетін және Қазақстан Республикасының экономикасының озық дамуын қамтамасыз ететін мобильді және динамикалық оқыту.
Университет қызметінің негізгі мақсаты – су ресурстары саласындағы мемлекеттік бағдарламаларды ғылыми қамтамасыз ету және сүйемелдеу, сондай-ақ кәсіби жоғары оқу орындары мен жоғары оқу орнынан кейінгі білім берудің барлық деңгейлерінде тиісті кадрларды даярлау.
Университет қызметінің негізгі мәні жаратылыстану және техникалық ғылымдар саласындағы білім беру қызметтері, ғылыми зерттеулер мен әзірлемелер.